La gestion séparée des biodéchets, via le retour à la terre de la matière organique, répond aux problématiques de la fatigue des sols. En effet, qu’ils soient traités via compostage ou méthanisation, le compost produit ou le « digestat » (issu du processus de méthanisation) présente des valeurs agronomiques, amendantes et fertilisantes très intéressantes pour les terres agricoles. Un avantage non négligeable en réponse à la fatigue de terres, à leur érosion, et la pénurie prévue des réserves de phosphore.
De plus, le processus de méthanisation permet de produire du biogaz, utilisable en électricité, chaleur ou biocarburant. Une action participant ainsi à la transition vers un modèle énergétique plus durable.